새문안교회는 새로운 2000년을 맞이하면서 하나님의 뜻이 새문안교회 뿐만 아니라 이 나라와 민족의 역사 위해 함께 하시기를 기원하여 '한국 기독교 2000년 위원회'를 조직하고, 이 사업의 일환으로 '새문안교회 언더우드기념 한국교회음악교육원'을 개설하였습니다.
새문안교회 언더우드기념 한국교회음악교육원(약칭:새문안교회음악교육원)은 교회음악과정 교육프로그램을 중심으로 그동안 목회자를 위한 교회음악세미나, 청소년 교회반주자를 위한 교회음악학교, 찬송가반주반, 시창발성학교, 계절학교 등 다양한 교육프로그램을 통해 개교회의 교회음악지도자를 양성하는 동시에 국내외의 우수한 합창단을 초청하여 교회음악연주회를 열어 한국의 교회음악발전을 위해 노력해 왔습니다.
현재는 교회음악과정에 주니어 성악클래스와 찬송가교실, 그리고 계절학기가 연중 교육으로 진행되고 있습니다.